Az intézetet 1844-ben alapították és 1895-ben vette fel az I. Kórbonctani Intézet nevet.
A graduális képzés keretében a Patológia tantárgy oktatását végzik mind az ÁOK, mind a FOK részére, mindkét Karon két-két szemeszterben . Az oktatás célja a klinikopatológiai szemlélet megalapozása, és a patológiai diagnosztikai lehetőségeinek bemutatása. A magyar nyelvű oktatás mellett angol ÁOK, angol és német FOK-képzés is folyik, a fentieknek megfelelő óraszámban. Kurzusokat tartanak az EFK-on. A tantermi előadásokhoz részben bonctermi, részben szövettani gyakorlatok csatlakoznak. Az oktatási infrastruktúra részei a színes tv-lánc, videoarchívum, diaanyag CD-ROM-on, valamint a konzultációs mikroszkóp/monitor rendszer és a telepatológiai rendszer. Az intézet szervezi az Onkológiai Kurzust és a Klinikopatológiai Kurzust (VI. éves hallgatók, valamint doktoranduszok számára).